直到会议结束，安全会议秘书和内务部长也没有主动站出来把这个问题说清楚，气得满腹委屈的联邦边防局长尼古拉耶夫在会议结束就向总统提交了辞呈。他在辞职报告中写道：“您1996年1月9日在克里姆林宫举行的会议上对我的批评和对边防军的评价已经为全国人民皆知，我内心极其沉痛地表示接受。我认为，作为俄罗斯联邦总统和最高统帅的您所说的话，等于您表示对作为俄罗斯联邦边防局领导人的我的不信任。因此，已不允许我继续履行公职和迫使我向您提出辞职的请求。”其实还没到散会的时候，叶利钦就已经觉察到对下级的批评搞错了目标。再者说事件刚刚发生，临阵易帅又是兵家大忌，所以，他没有接受这位局长的请求。但是，叶利钦发怒也自有他的道理，因为早在上年12月15日的时候，有关部门就收到过恐怖分子准备袭击基兹利亚尔市的情报。三天前，又有线人提供了匪徒准备进入达吉斯坦的消息，可是，这些情报不知为什么都没有引起足够的重视。

　　紧急会议结束了，叶利钦决定由联邦安全局长巴尔苏科夫牵头，有些重要环节由他亲自过问，采取果断措施对付恐怖分子。有些观察家认为，总统所以勇敢地站到前台有两个目的：一是要表明坚决与恐怖分子斗争的决心；二是要告诉半年前放跑了巴萨耶夫的切尔诺梅尔金等一班人，应该怎样对付恐怖分子。
　　基兹利亚尔市的谈判仍在紧张地进行中，联邦方面的代表是达吉斯坦政府官员，非法武装的决策人就是“孤狼”拉杜耶夫。此人生于1967年，在制造这起震惊世界的恐怖事件时只有28岁。他的童年是在车臣南部尤尔特区戈尔达利度过的。中学毕业后曾经在市商业管理局当过建筑工人，后来应征入伍，服役期间还参加了苏联***。复员后的拉杜耶夫在工作中表现也比较好，曾经当选过车臣—印古什共和国共青团委员会委员。车臣宣布独立后，年轻的拉杜耶夫被派到车臣第二大城市古杰尔梅斯担任行政长官，是当时车臣最年轻的干部，对杜达耶夫也最忠诚。

　　第一次车臣战争爆发后，拉杜耶夫曾经带人抢劫过莫斯科进行人道主义援助的物资，在车臣东部和达吉斯坦境内制造过多起毁路、炸桥、袭击俄军的事件。1995年3月以后，他随杜达耶夫进入深山，成为狂热的民族主义分子和“复仇狂”。在古杰尔梅斯，他竟然在众目睽睽之下，亲手杀死了五名受了伤的俄军战俘，让人感到他就像狼一样凶残。

　　在谈判过程中，拉杜耶夫坚持的条件是：俄罗斯必须撤走1994年以来进入车臣的军队，后来又把条件提高到让俄军撤出整个高加索。否则，他们就要与人质及整个基兹利亚尔市一起化为灰烬。代表俄罗斯参加谈判的达吉斯坦官员则警告匪徒，如果不释放人质，他们将全部被消灭。此外，他们的家属及亲人也将遭到被他们杀害的人质亲人的报复。谈判一直进行到10日清晨，拉杜耶夫终于让步了。他同意释放大部分人质，交换条件是给他们提供交通工具，同时保证他们的安全。

　　10日早6时45分，大约300名恐怖分子登上了为他们提供的11辆大客车和两辆卡车。为了保险，匪徒们仍然扣留着162名人质，其中包括十几名达吉斯坦的部长、俄罗斯国家杜马议员和新闻记者。
　　这天，叶利钦按原计划飞往法国，进行了总计27个小时的访问（包括途中），但基兹利亚尔市的一切都在他的掌握之中。
　　十多辆汽车在驶离被歹徒占领了20多个小时的医院后，向车臣方向开去。目标是车臣首府以东50公里的新格罗兹年斯基。但当他们行驶到达吉斯坦边城哈萨维尤尔特附近时，突然发现通往车臣的桥梁已被炸毁。歹徒命令跟在后面的俄军赶紧调工兵修桥，否则就要杀害人质。但经双方共同派员实地查看，被毁的桥梁确实在短时间内无法修复，车队只好拐进了路边的“五一村”。只有几十户人家的“五一村”坐落在高加索为数不多的一小块平原上，周围无遮无挡。如果使用重武器，很快就能将其夷为平地，但若想不伤及人质，进攻一方在通过开阔地时，势必要做出较大牺牲。

　　恐怖分子进入村庄后，马上把当地的200多名居民赶到一个地方，又被当成了人质。他们还袭击了内务部队的一个哨所，扣押了37名官兵。这样一来，掌握在恐怖分子手中的人质又达到了300多人。一直尾随在歹徒后面的俄军在发现上述情况后，马上在距村庄500米左右的地方布下第一道封锁线，将匪徒围得水泄不通。为了防止发生意外，内务部队还调集了2000多名士兵、30多辆坦克、装甲车和几架武装直升机，在距村庄2—3公里的地方形成了第二道防线。

　　双方的谈判重新开始，但武装分子不仅坚持原来的条件，还扣留了前来谈判的达吉斯坦共和国国务委员会主席穆罕默多夫、政府总理米尔扎别科夫，使谈判陷入了僵局。
　　1月13日，在两天的谈判都没有取得进展的情况下，步步紧缩的俄军向非法武装分子下达了最后通牒，限他们在14日上午10时前释放全部人质。时间一分一秒的过去了，但是当14日10时到来的时候，俄军没有发动进攻，歹徒也没有放下武器。在这个关键时刻，叶利钦决定再给对手一次机会。毕竟几百名人质在歹徒手里，万一他们大开杀戒，即使消灭了所有匪徒，整个行动也是失败的。到那时，他将何以面对人质的妻儿老小，何以面对媒体和全国人民。可是小小的拉杜耶夫偏偏不给叶利钦面子，尽管最后通牒的时间延长了一次又一次，好话说了一遍又一遍，歹徒就是软硬不吃。

　　14日下午，俄军将包围圈进一步缩小，同时通过高音扬声器敦促歹徒投降。拉杜耶夫误以为俄军发动了进攻，于是下令对俄军射击，同时用“地对空”火箭攻击俄军的直升机。
　　15日凌晨，俄军发现从车臣方向来了一股匪徒，估计是杜达耶夫为自己的侄女婿派来的援兵，同时，他们截获并破译了杜达耶夫给拉杜耶夫的指令，告诉他援兵已到，可以屠杀人质，随后突围。几天来一直守候在“前线”的联邦安全局长巴尔苏科夫在得到这个消息，同时确认有的人质已经遭到杀害后，马上下达了强攻的命令。
　　首先发动攻击的是武装直升机，他们的轮番轰炸和扫射很快就把小小的“五一村”变成了一片火海。空中打击停止后，乘恐怖分子还没有进入防御阵地，坦克就掩护着联邦内务部队和联邦安全局特种部队冲进村庄，官兵们一面同匪徒搏斗，一面解救人质。在几天来进行谈判的过程中，俄军已经通过空中侦察，清楚地掌握了人质关押地点，所以刚一发动进攻，就占领了关押人质的清真寺和一所小学，使歹徒大量杀害人质的阴谋未能得逞。由于非法武装分子拼命抵抗，手中又有一部分先进武器，有人身上还捆绑着用于自杀的丨炸丨弹，所以，战斗进展得非常缓慢。几乎每间房屋、每幢建筑都要争夺，每前进一步都要付出代价。经过将近三天的搏斗，18日下午，联邦军队终于占领了这座小村庄，基兹利亚尔市人质事件以与布琼诺夫斯克事件完全不同的方式结束。

　　在这次事件中，有153名恐怖分子被打死，20人被俘。82名人质获救，18名失踪。俄军方面26人阵亡，93人负伤。其中国防部各部队6死19伤，内务部内卫部队4死24伤，“阿尔法”特种部队2死1伤，内务部机关14死49伤。事件结束的当天，叶利钦发表了一份告俄罗斯公民书。他在面对全国人民的讲话中说：今天，1月18日，联邦军队制止杜达耶夫非法武装分子在达吉斯坦恐怖行动的战斗已经结束。采取这一行动是不得已而为之。几天来，匪徒们把无辜的公民扣为人质，联邦当局和达吉斯坦共和国领导人使用了一切可能使用的和平手段。恐怖分子一次又一次地拒绝履行自己的承诺，越来越厚颜无耻和肆无忌惮。遗憾的是，有军人及和平居民在这次行动中牺牲，杜达耶夫和他的非法武装分子应对此承担责任。恐怖主义没有民族性，我们从来都没有、将来也不会在匪徒和车臣人民之间画上等号。杜达耶夫非法武装分子实际上已失去取得车臣广大人民支持的希望。在达吉斯坦土地上、在基兹利亚尔和五一村播种死亡和大肆破坏之后，现在他们又试图把自己的行动扩大到其他地区，并且企图不仅把车臣人民而且把整个高加索人民变成自己的人质，这是绝对办不到的！我呼吁车臣共和国居民：协助当局和执法机关对付非法武装分子，使践踏人性准则的那些人受到应有的惩罚。我呼吁达吉斯坦人民、北高加索人民、哥萨克人民保持克制，在保卫俄罗斯不受恐怖主义威胁的事业中，把我们团结在一起的不是复仇心理，而是理智。我们以前说过，并且现在重申：“我们的目标是，在车臣恢复宪法秩序、和平和安宁。倘若武装匪徒胆敢阻挠实现这一目标，我们决不留情。绝不允许向恐怖主义让步，不予以惩罚只会引发新的犯罪。那些还想恐吓俄罗斯人、颠覆俄罗斯政权、破坏俄罗斯联邦和平生活的人应该明白这一点。”

　　发生在基兹利亚尔市的人质事件本身、处理办法及其结果，对联邦政权和杜达耶夫非法武装来说可谓两败俱伤。对于莫斯科来讲，基兹利亚尔事件告诉人们，车臣战争不仅没有结束，恰恰相反，这场动用了十多万人马，耗时一年多的讨伐，只不过是把战场从车臣境内转到了境外，转到了俄罗斯。如果说半年前的布琼诺夫斯克事件仅仅是个偶然，让人们觉得战争离自己还很远的话，基兹利亚尔事件则让俄罗斯和平居民觉察到危险已经来到身边。