公历10月19日，孙峻病逝，孙綝被吴主孙亮加封为侍中、武卫将军、都督中外诸军事，因主战的孙峻已去，于是命令吕据等人退还。吕据是东吴的高族，听说孙綝从一个偏将军骤然擢升为主持国家大事的权臣，登时火冒三丈。他仗着手中有兵，于是和手下的将领联名 向朝廷上表，要求以滕胤为丞相辅政。滕胤和吕据关系莫逆，两者又同娶夏口督孙壹之妹，用现在的话说叫连襟，因此吕据盼着滕胤能够上位。孙綝听说这个消息后，因10月21日老寿星大司马吕岱去世，将滕胤改任大司马，并派遣他去武昌镇守，想将滕胤彻底排挤出权力中心。滕胤当然不愿意就此被逐出朝，正在为难之际，他接到了吕据派人送来的密信。吕据说他已引兵回军，要和滕胤联手废掉孙綝。滕胤因诸葛恪被杀一事对孙家兄弟早有不满，因此一拍即合。吴国一场动乱就此拉开帷幕。

　　孙綝听说吕据兴师问罪，派遣自己的堂兄孙宪率兵到江都抵御吕据，并以吴帝孙亮的口吻命令仍在吕据军中的文钦、刘纂、唐咨一起攻打吕据。孙宪和孙峻、孙綝都是堂兄弟，当年曾参与诛杀诸葛恪，因此被孙峻倚为左右手，此时官拜右将军、无难督，平九官事，真正是“打虎亲兄弟，上阵父子兵”，孙宪接到命令后没二话即出师北向。为了分化吕据和滕胤的攻守同盟，孙綝又命令侍中左将军华融、中书丞丁晏催促滕胤尽快去武昌上任。

　　滕胤见这两人咄咄逼人，索性一不做二不休，直接将这两人扣在自己帐下，又令典军杨崇、将军孙咨声言孙綝反叛，迫使华融和丁晏向孙綝寄书质问。孙綝势如骑虎，怎肯轻易罢休，华融的书信他不加理会，上表直言滕胤作乱。孙綝还对将军刘丞说，滕胤犯上作乱，只要你参与平乱我就给你封爵。刘丞听后即率兵围攻滕胤。滕家虽有一定的部曲，但人数远远不够，华融作为左将军，手中倒是有兵。滕胤于是令华融写伪诏发兵。华融没有听从，滕胤将他和丁晏一起诛杀。

　　当时摆在滕胤面前的有这样几种选择：一是干脆进宫劫持孙亮在手，不怕孙綝以皇帝的名义继续发号司令，但这样有挟上之实，日后孙亮当国后肯定会秋后算账；二是像他的部曲建议的那样，率领军队到苍龙门与孙綝对峙，滕胤毕竟在宦海打拼多年，声望远高于孙綝，只要振臂一呼，孙綝的部众很可能瞬间倒戈；第三种是放弃在建康城的观望，直接带兵去找吕据，两人合兵一处来与孙綝一分高下；最后一种就是稳坐原地，以全力与孙綝周旋，等待吕据的救兵。滕胤选择的就是这最后一种，并且他告诉部曲，吕据马上就要到了，你们可以安心。众人见滕胤谈笑如常，且认为吕据大军一到孙綝只有授首，所以在初起阶段无人背叛。可惜从半夜直到破晓，吕据一直没来，刘丞却带着军队杀到了。滕胤部众太少，孙綝大杀一阵，并趁机夷灭了滕胤三族。

　　孙綝趁此机会成为头号辅政大臣，因孙亮年才十四岁，所以孙綝成为吴国的当家人。滕胤敢于藐视孙綝，孙綝免不了向他头上大泼污水，还在11月10日举行了带有庆贺意味的大赦，并改年号为太平。滕胤一去吕据势孤，文钦等人又站在孙綝一方，可谓已毫无胜算。有人劝说吕据投奔魏国，吕据说：“我耻为叛臣。”于是自杀。
　　要说孙峻当权时虽然也没办过什么正事 ，但对大臣们面子上还过得去，孙綝可就不同，在他当权的第一个月里，他就和曾经帮过自己大忙的堂兄孙宪吵翻了脸。在孙峻时代，因为孙宪曾经参与诛杀诸葛恪，所以孙峻不仅委任他为右将军，而且基本上是有求必应，孙宪对此深表满意。然而孙綝对他就吝啬得多，孙宪不禁大怒，于是和将军王惇密谋杀掉孙綝。结果事情败露，孙綝杀掉王惇，孙宪被逼服毒自杀。

　　吕据和滕胤被杀后，余音一直持续到次年六月才宣告结束。因孙壹是吕、滕二人的大舅哥，所以孙綝命令镇南将军朱异进讨孙壹。孙壹处理事情比吕据灵活得多，他听说朱异已从虎林进兵至武昌，便举家投奔魏国。魏国人正想用一位敌对势力的高级官员来宣传王化，吸引吴、汉两国的高级官员继续投奔，于是对孙壹甚为礼遇，不仅拜他为车骑将军、交州牧，还封吴侯，并开府辟召，享有仪同三司的特权。