努尔哈赤死去之后，皇太极便以先帝有遗言为由，命人将大妃乌拉那拉氏和两个庶妃殉葬，为自己继承汗位扫清了道路。之后，代善与其子萨哈廉以及阿济格便一同拥皇太极嗣汗位。
　　盛京，大政殿。
　　代善对诸贝勒大臣说道：“四贝勒才德冠世、战功赫赫，深契先帝圣心，众皆悦服，当速继大位。”
　　众人见到身为长兄的代善都在鼎力支持皇太极，而且努尔哈赤的大妃都已经殉葬了，此时还有谁会提出异议？所以众贝勒乃合词请皇太极嗣位”，皇太极“辞再三次，久之乃许”，于是被众人拥举为大汗。
　　天启六年（后金天命十年），七月初。皇太极在盛京大政殿即汗位，焚香告天，宣布次年为天聪元年。
　　皇太极鉴于大金新败于汉威军之手，各旗将士士气低落、国钱粮匮乏、地方人心涣散，于是下令登基大典一切从简，以便节省钱粮。在正式登基之后，皇太极便迫不及待的召集了所有贝勒大臣在大政殿议事，开始着手处理大败之后的善后事宜。
　　看着满朝的武，坐在龙椅之的皇太极忽然有了一种天下在手的感觉，但是这种感觉并没有持续多久，被残酷的现实将其拉了回来。皇太极皱着眉头看了看案前堆积如山的奏折，开始静下心来处理宁远大战之后的善后事宜。
　　在理顺了诸多事务之后，皇太极下达的第一道旨意是各旗大军立即南下接管辽南地区，将战线推至辽河一带，和汉威军隔辽河对峙；其二，下令丈量全国土地，将“各处余地”全部归公，发给民户耕种，不许各旗旗主、贵族再私立庄田；其三，把原来每十三名壮丁编为一庄改为每八名壮丁编为一庄，“其余汉人，分屯别居，编为民户。”并下令编审壮丁，解放部分奴婢为编民，以此充实民力、发展生产。

　　皇太极的这些措施，使建奴贵族的特权受到一定制约，但是有利于发展农业生产，有利于壮大金国的国力，代善和阿济格也是全力支持和配合皇太极的旨意。而其余的建奴贵族见状，虽然心有些不满，但是也不好出面阻止，只能是硬着头皮去执行。

　　紧接着，皇太极又连下几道旨意，废除了大汗与三大贝勒俱南面坐，共理朝政的旧制，改为自己南面独坐，突出汗位独尊的地位，使汗权得到了巩固，使得自己颁布的政令可以不受丝毫阻拦的贯彻下去；再有，皇太极还下令改革政制，仿明制，内设三院、六部，停王贝勒领部院事，自己独主政务，又设都察院和理藩院，建立起一套较为完备的国家机构，完全架空了原先的建奴贵族，使得金国国政完全落入了皇太极的掌控之。

　　与此同时，皇太极有感于各旗大军伤亡惨重，兵力有些捉襟见肘，已经无法应对来自汉威军的威胁了，于是为了扩大兵源，便创立了汉军八旗和蒙古八旗，汉八旗和蒙古八旗各旗分别隶属于建奴八旗相对应的各旗；同时，皇太极还不顾代善和阿济格的强烈反对，下旨在汉军八旗建立乌真超哈火器营，开始打造火铳和火炮，以便和汉威军犀利的火器抗衡。
　　眼见皇太极刚一台颁布了这么多重大的改革措施，大有全盘修改金国国政的势头，代善心暗道：“大汗这是要全面推翻父汗的施政路线啊！只是不知道，大汗的这些举措能不能让大金走出眼前的困境了。”
　　在代善暗自想着心事的时候，皇太极又公布了一个惊人的决定：重新任命八旗旗主！由皇太极自己管辖两黄旗，同时任命代善为正红旗旗主，阿济格为镶红旗旗主，豪格为正蓝旗旗主，济尔哈朗为镶蓝旗旗主，多尔衮为正白旗旗主，多铎为镶白旗旗主。

　　当听到原先由自己统领的两红旗被一分为二，镶红旗被分给阿济格的时候，代善的心充满了愤怒，一种被欺骗了的感觉瞬间涌了心头。于是，代善猛地抬头看向了龙椅的皇太极，刚想开口争辩一二，却发现皇太极也在盯着自己，眼神之满是凌厉之色。此时，代善心猛然一惊，瞬间反应了过来：现在自己已经是臣子了！于是，代善急忙低下了头表示顺从。
　　“是了！大汗将济尔哈朗、多尔衮、多铎三人拉进来充当旗主，是要与我和阿济格分庭抗礼、彼此互相牵制。而将正蓝旗交给豪格，则是准备给自己的儿子铺路了！”
　　想到这里，代善心有了一丝后悔，但是转念一想，现在的大金国也只能是皇太极这样狠决的人来领导，才会有振兴的希望，否则的话还真的会有亡国之危！
　　于是，代善长出了一口气，又恢复了老神在在的模样，继续聆听皇太极的旨意。
　　“从今以后，各旗选出精锐甲兵充当巴牙喇，作为每旗的精锐战兵和旗主的护卫……”
　　大殿之，众人静静聆听着皇太极的旨意，一个念头在众人的心冒了出来：“大汗登基之后，也许大金国真的要变天了！”
　　在接下来的两个月之，皇太极开始了重整八旗军力的行动，科尔沁蒙古、各地汉民青壮、奴儿干都司山林的野女真全部被集结了起来，在代善、阿济格等旗主的主持下，开始了建奴八旗、蒙古八旗和汉八旗的整编事宜。
　　与此同时，皇太极还在不断完善建奴的内政、官制，并且大力恢复生产、囤积钱粮兵械。为了筹建乌真超哈营，皇太极在盛京城郊专门开辟出了一处规模宏大的作坊，用于打造火炮和火铳之用；皇太极眼见火器作坊缺少铁料和专门的人才，特意派人携带大量的财货和晋商接触，委托晋商为建奴筹集相关的人才、物资。
　　短短两个月的时间，原本呈现颓势、士气低落的金国，便开始恢复了生气，无论是国力还是军力都开始缓慢的升了。眼见于此，代善、阿济格、济尔哈朗等旗主都对皇太极这位新汗新生畏惧，都觉得其深不可测，办起差来都是尽心竭力，不敢有丝毫的怠慢。

　　天启六年（后金天命十年），十月初。
　　皇太极在理顺了内政事务之后，便将代善、阿济格、豪格、济尔哈朗、多尔衮、多铎六名旗主全部召集回京，在大政殿举行了朝会，并且将建奴的贝勒大臣也召集到场。
　　皇太极身穿龙袍坐在龙椅，看着下首毕恭毕敬的群臣、旗主，心无快意。皇太极先是说了一下自己登基以来所做过的重大举措，以及相关的成效，之后便宣布了一个惊人的决定：改大金国号为大清，改建州族名为满洲！
　　此话一出众人哗然，大殿之顿时爆发出了一阵巨响，众人纷纷出言反对，开始大呼小叫起来。连代善也是一反常态，言辞激烈的说道：“大汗，国号、族名都是天命汗钦定的，这怎能轻易更改！国号都变了，那岂不是自行亡国了！”
　　话音刚落，满朝武像是找到了知音一般，更加群情激奋了起来，纷纷出言反对皇太极的决定，大殿之的局势瞬间变得有些失控了。
　　大殿之，众多的贝勒大臣之只有豪格、多尔衮、多铎三人沉默不语，只是静静的看着争论不休的武的大臣。不过不同的是，豪格是想帮着皇太极说话，但是自己人微言轻，没有什么傲人的功勋作为支撑，那些贝勒大臣几乎没人会理会自己；而多尔衮和多铎则是在一旁看着笑话，想要看看皇太极准备如何应对眼前的局面。