通过分析可以看到，自由亚齐运动主要以军事斗争为主，其组织力量相对薄弱，直接参加武装斗争的人数较少，斗争规模较小。
　　虽然一些成员在国外接受了军事训练，武装力量有所增强，并占据了亚齐地区的一些边远村庄。但总体上看，自由亚齐运动与印尼政府的军事力量对比悬殊。
　　其次，自由亚齐运动在亚齐社会产生了一定的影响，但总的来看，社会支持不足。
　　哈桑－迪罗试图得到国外援助，忽视当地的社会力量。
　　据说，哈桑－迪罗在回到印尼之初，会见了包括50年代亚齐地方叛乱首领达乌德－贝鲁在内的一些当地的乌里玛，试图获得他们的支持。
　　但是由于他把希望更多得寄托于西方国家的援助，担心明确表示建立伊斯兰教政权会引起西方的偏见，所以没有接受达乌德－贝鲁建立伊斯兰教政权的建议，致使后者拒绝动员广大群众参加自由亚齐运动。
　　随后，自由亚齐运动规模和影响日益发展，得到了社会各阶层不同程度的支持，如知识分子、失业工人和贫苦的农民。
　　这是一方面是由于其明确主张建立一个伊斯兰教政权，符合亚齐当地乌里玛的愿望，对民众有更大号召力。
　　另一方面，由于当地的经济、文化等方面落后，使亚齐社会对中央十分不满，为了本地区的发展，分离思想已经开始出现在当地官僚、公众领袖和民众中，因此自由亚齐运动的主张有一定的号召力。
　　尽管如此，这一时期独立主张并不符合亚齐社会各阶层的意愿，当地群众并没有统一的独立意愿，而是处于模棱两可的状态，他们既同情自由亚齐运动，但又不认为独立是解决问题的最终途径。
　　他们对中央政府抱有希望，试图通过斗争获得地方自主权。所以，在这个阶段，自由亚齐运动的力量得到了一定的发展，但其独立主张并没有被多数亚齐人认同，在当地的影响也是有限的。
　　而苏哈托政权对亚齐采取的政策始终是以政治和经济上的严密控制、军事上的镇压为主。
　　具体表现为：
　　一、对亚齐采取严密的控制措施。虽然苏加诺政府给予亚齐特别行政区地位，规定亚齐在政治、经济、文化宗教等事务上拥有相对自主的管理权，但到苏哈托政府时期这些规定却形同虚设。
　　苏哈托总统上台后，强调稳定与发展，在政治上，稳定表现为通过建立完全的军人统治，依靠武装部队控制国家，实行总统——执政的专业集团——军人三位一体式的统治体制。
　　在地方行政机构中，任命大批军官担任从省长、县长直到乡长的各级行政首长，剥夺地方的自主权。

　　在经济上，发展表现为，将大批的在职和退休的军官安插在重要的经济部门，控制地区的经济生产。
　　同时地方收入绝大部分上缴中央，中央在分配过程中对少数地区实行严重的政策倾斜。
　　后来，北亚齐地区发现大量的天然气，并于转年开始生产，然而这并没有给亚齐当地的经济与社会发展带来任何益处。
　　天然气的收益直接归为中央，而亚齐当地人民本来期望随着工业的发展会出现更多的就业机会，但这些职位大多被从爪哇的移民所占有。
　　繁荣的工业区与亚齐其他落后的农业地带、爪哇人的高收入与亚齐本地人民的贫困生活形成了鲜明的对比，地区对中央、民族间的不满情绪日益增加，社会各阶层提出不同的建议以促使当地的经济与社会发展。
　　而自由亚齐运动为代表的独立主张就是这种不满情绪的极端表现。
　　印尼中央政权对亚齐自由运动采取坚决的军事镇压，对于亚齐地区的分离主义运动，以军人为基础的苏哈托政权采取两手政策。

　　一方面在亚齐修建公路，从政治上抚慰多数亚齐人，但并没有从采取真正有效的措施发展亚齐当地的经济。
　　另一方面对自由亚齐运动采取坚决的军事镇压。
　　在政治和经济方面的政策失误是亚齐分离运动产生的根源，而军事方面的高压政策并没有消除亚齐地区的分离倾向，反而使该问题积重难返。
　　尤其是印尼军人在亚齐建立军事占领区，准备对亚齐进行长时间的军事统治。
　　据报道，这期间，军队滥用职权，从恐吓到绑架、从**到屠杀，严重践踏了人权，大约有2000多平民因为被怀疑与自由亚齐运动有联系而被杀，许多人被逮捕、审讯。

　　军事行动没有把自由亚齐运动彻底消灭，反而殃及无辜平民，使整个亚齐处于深重的民族灾难和仇恨中，中央与地方矛盾、尤其是民族矛盾被大大激化。
　　这对亚齐当地的分离倾向产生的推动力远远大于自由亚齐运动的号召力和影响力，可以说这是分离运动全民化的重要转折点。
　　在这种情况下，亚齐当地的媒体上陆续出现了揭露军人暴行的报道，而且一石激起千层浪，亚齐当地社会要求撤军、对军人暴行进行审判和对受害者的补偿的呼声日益高涨。
　　由于正值印尼处于南华联邦共和国的进攻时期，印尼中央政府无法迅速地做出回应，致使亚齐局势日益动**。
　　1958年1月末，全亚齐学生组织发动集会，要求就亚齐的政治地位进行全民公决。
　　自由亚齐运动重新活跃起来，流亡海外的自由亚齐运动成员回到亚齐，并取代学生组织开始进行全民动员，试图以独立的要求取代民族自决。

　　其武装力量中出现了一支所谓的雇佣军，致使与印尼中央政府军队的冲突不断升级，使亚齐的局势渐趋恶化。
　　这以前，游击队的活动中心集中在东亚齐，而现在，自由亚齐运动的活动已经遍及全省。
　　该组织现有17个根据地，每个根据地有7个军事司令部，并拥有自己的军队、丨警丨察甚至海军陆战队，共17000名人员。
　　此外，自由亚齐运动自称已经在60个国家设有代表处。
　　需要指出的是，除了自由亚齐运动的分离主张外，对于亚齐的走向，在当地存在着不同的意见，如学生运动主张公民投票，地方政府则主张实行特别自治区。
　　亚齐分离活动的扩大加上帝汶群岛的独立，在印尼其他一些地区引起了负面的连锁反应，这使拥有1．7万个岛屿的印尼共和国面临解体的危险。

　　印尼国内精英人士甚至担心，处理不好，印尼将整个国家将处于四分五裂的状态。
　　面对亚齐的混乱局势，印尼各届政府都在坚持国家统一的前提下，试图通过给予亚齐地区更多的地方自治权，以控制亚齐的分离倾向。
　　对于以自由亚齐运动为代表的武装独立力量，印尼中央政府曾通过和平谈判、签订停火协定等措施加以控制，但并没有从根本上解决问题。
　　值得注意的是，对军队在亚齐地区侵犯人权的暴行进行调查是亚齐分离运动再次兴起的导火索之一，但印尼中央政府，对这一问题都基本采取避而不谈的政策，这是与印尼的政治特征密切相关的。

　　然而，正如亚齐的一些温和的***组织所言，如果最初政府能够对一些军人的暴行进行审讯调查，也许事态不会从要求全民公决发展到独立运动。